微生物分离纯化方法
- 2026-07-22 13:55:18
- 逗点生物
微生物分离纯化方法
微生物样品中常含有多种细菌、酵母、霉菌或放线菌。若要研究某一菌株的形态、生理生化特征、产酶能力或培养基适用性,首先需要将混合菌群分离成相对纯的单一菌株。微生物分离纯化的核心思想,是通过稀释、划线、选择性培养或单细胞操作,使单个或少数微生物细胞在培养基上形成彼此分开的菌落,再挑取目标菌落进行纯化和鉴定。
常见分离纯化方法包括平板划线法、稀释涂布平板法、稀释混合倒平板法、稀释摇管法、液体培养基分离法、选择培养分离法和单细胞分离法。其中,平板划线法、稀释涂布法和倒平板法最常用,操作相对简单,不需要复杂仪器,适用于大多数基础微生物实验。
一、分离纯化的基本原则
分离纯化并不是“看到单个菌落”就一定得到纯菌。一个菌落通常由一个细胞、一个孢子或一个细胞团繁殖形成,因此更准确的单位是CFU,即菌落形成单位。若样品中细胞成团、链状排列或菌丝断裂不充分,一个菌落可能来源于多个细胞。
因此,获得疑似单菌落后,还应进行再次划线纯化,并结合菌落形态、显微形态、染色结果和必要的生化或分子检测确认纯度。对于混合菌样品、环境样品和食品样品,通常需要经过2次以上单菌落纯化,才能作为后续实验用菌株。
二、平板划线分离法
平板划线法是最常用的菌种纯化方法。操作时,用接种环或一次性无菌接种环蘸取少量待分离材料,在固体培养基表面按一定路线连续划线。随着划线区域推进,接种环携带的细胞数量逐渐减少,最终可在平板后部形成分散的单个菌落。
常见划线方式包括三区划线、四区划线、连续划线和平行划线。无论采用哪种方式,关键都是逐步减少接种量,并避免划线过密或反复破坏琼脂表面。
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 主要用途 | 菌种纯化、混合菌分离、观察菌落形态 |
| 优点 | 操作简单,成本低,可获得分散菌落 |
| 缺点 | 不能准确计数,结果受操作者技术影响较大 |
| 适用样品 | 菌液、菌落、污染样品、发酵液、环境分离物等 |
平板划线法特别适合从混合培养物中挑取单菌落,也适合复核菌株纯度。若划线后所有区域均密集生长,说明接种量过大或划线稀释效果不足,应减少取样量或增加划线分区。
三、稀释涂布平板法
稀释涂布平板法是将样品制成系列稀释液后,取一定体积滴加于固体培养基表面,再用无菌涂布器均匀涂布。培养后,微生物在平板表面形成菌落,可用于分离单菌落,也可用于活菌计数。
原文称“一个菌落代表一个单细胞”不够严谨。准确说法是:一个菌落代表一个菌落形成单位。该单位可能是一个单细胞,也可能是一个细胞团、一个芽孢、一个酵母细胞或一段菌丝。
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 主要用途 | 活菌计数、目标菌分离、培养基回收率评价 |
| 优点 | 可计数,可观察平板表面菌落形态 |
| 缺点 | 接种体积较小,样品分散不充分时误差较大 |
| 关键点 | 选择合适稀释度,使平板形成可数且分散的菌落 |
稀释涂布法并不只是用于“筛选菌株”,更常用于食品、水、土壤、菌剂和培养基性能评价中的活菌计数。若用于筛选菌株,也通常需要结合选择性培养基、显色培养基或特定功能检测方法。
四、样品稀释液的制备
样品稀释的目的是降低微生物浓度,并尽量使细胞或孢子分散。常用稀释液包括无菌生理盐水、磷酸盐缓冲液、蛋白胨盐水或标准方法规定的稀释液。不同检测标准对稀释液、均质方式和稀释时间可能有具体要求,应优先按标准执行。
以固体样品为例,可称取10 g样品加入90 mL无菌稀释液中,经均质、振荡或拍击处理,制成10⁻¹稀释液。随后取1 mL 10⁻¹稀释液加入9 mL无菌稀释液中,混匀后得到10⁻²稀释液,以此类推制备10⁻³、10⁻⁴、10⁻⁵等系列稀释液。
稀释操作应注意:
每一步稀释前必须充分混匀;
每个稀释度应更换无菌吸头或移液管;
稀释液不宜长时间放置后再接种;
易沉降样品应在混匀后立即取样;
含菌团、菌丝或颗粒较多的样品,应选择合适均质方式。
原文中的“吹吸3次”只能作为最低混匀动作,实际操作中常需涡旋、振荡或拍击均质,以提高细胞分散程度。对土壤、粉末和霉菌孢子样品,适当加入玻璃珠或表面活性剂有时可改善分散效果,但应确认其不影响目标菌活性。
五、稀释度和接种量选择
选择稀释度时,应使培养后平板上形成可分辨、可计数的菌落。细菌计数常参考30~300 CFU/皿的范围;霉菌、酵母或特殊方法可能采用不同可计数范围,应以相应标准为准。
常见样品可参考以下稀释范围:
| 样品或目标微生物 | 常用参考稀释度 |
|---|---|
| 高浓度细菌菌剂 | 10⁻⁷~10⁻⁹ |
| 土壤细菌 | 10⁻⁴~10⁻⁶ |
| 土壤放线菌 | 10⁻³~10⁻⁵ |
| 土壤真菌 | 10⁻²~10⁻⁴ |
| 食品或水样 | 根据污染水平和标准要求选择 |
这些范围只是经验参考。实际检测应根据样品含菌量、目标菌生长速度、培养基选择性和预实验结果调整。若菌液密度过高,平板会出现菌落融合,无法获得单菌落或准确计数;若稀释度过高,则菌落过少,代表性不足。
涂布接种体积通常为0.1 mL,也可根据方法采用0.05 mL、0.2 mL或其他体积。接种体积过大时,液体不易被培养基表面吸收,容易造成菌落蔓延和分布不均。
六、涂布操作要点
涂布前,平板表面应适度干燥。表面水分过多会导致菌液流动、菌落蔓延或边缘聚集;平板过干则可能影响细胞恢复和菌落形成。
传统玻璃涂布器可用75%乙醇浸泡后火焰灼烧,待酒精完全燃尽并充分冷却后再接触菌液。若涂布器未冷却,会造成目标菌热损伤;若带有过多乙醇,会抑制微生物生长。现在也常使用一次性无菌L形涂布棒或无菌玻璃珠,以减少火焰使用和交叉污染风险。
需要注意的是,在生物安全柜内通常不推荐使用明火,避免破坏气流、损伤过滤系统或引发火灾。处理致病菌或疑似致病菌时,应按生物安全要求选择无火焰操作方式。
七、稀释混合倒平板法
稀释混合倒平板法是将一定体积稀释液加入培养皿,再倒入冷却至约45~50 ℃的熔化琼脂培养基,轻轻旋转混匀,凝固后培养。微生物可在培养基内部和表面形成菌落。
该方法常用于活菌计数,接种体积通常可达到1 mL,因此检出能力高于普通0.1 mL涂布法。但其缺点是目标菌需要短时间接触温热培养基,热敏微生物可能受损;同时,培养基内部菌落较小,严格好氧菌的生长也可能受到限制。
| 项目 | 涂布平板法 | 倒平板法 |
|---|---|---|
| 接种位置 | 培养基表面 | 培养基表面和内部 |
| 常用接种量 | 通常0.1 mL | 通常1 mL |
| 菌落观察 | 表面菌落清晰,便于挑取 | 内部菌落较小,挑取较困难 |
| 对好氧菌影响 | 较适合严格好氧菌 | 内部缺氧可能影响好氧菌 |
| 对热敏菌影响 | 无温热琼脂损伤 | 可能受45~50 ℃琼脂影响 |
八、选择培养分离法
选择培养分离法是利用培养基成分、pH、温度、氧气、盐浓度、抗生素、染料或特定底物,抑制非目标菌并促进目标菌生长。常见选择性培养基包括麦康凯琼脂、XLD琼脂、Baird-Parker琼脂、孟加拉红培养基等。
选择培养法适合从复杂样品中分离目标菌,如食品、环境、水样和临床样品中的特定微生物。但选择性培养基并非绝对专一,目标菌可能被过强选择剂抑制,非目标菌也可能出现突破生长。因此,选择培养后的疑似菌落仍需进一步确认。
九、液体培养基分离法与富集培养
液体培养基分离法常用于目标菌数量低、受损菌较多或背景菌复杂的样品。通过选择性富集或增菌培养,可提高目标菌比例,再转接到固体培养基上分离单菌落。
例如,沙门菌、李斯特菌、阪崎克罗诺杆菌等检测中常需要预增菌和选择性增菌步骤。富集培养的优点是提高检出率,缺点是可能改变原始菌群比例,因此不适合直接用于定量分析。
十、单细胞分离法
单细胞分离法是借助显微操作、流式分选、微滴分离或微量稀释技术,直接获得单个细胞并进行培养。该方法适用于形态相近、常规平板难以分开的微生物,也可用于环境微生物、藻类、原生动物或特殊菌株分离。
单细胞分离准确性高,但对设备、操作技术和培养条件要求较高。对于生长条件未知或依赖共生关系的微生物,单细胞分离后未必能够顺利培养。
十一、纯化后的确认
分离得到的单菌落应再次划线纯化。纯化后可从以下方面确认菌株是否纯净:
| 检查项目 | 判断重点 |
|---|---|
| 菌落形态 | 颜色、大小、边缘、表面、透明度是否一致 |
| 显微形态 | 细胞形态、排列、大小是否一致 |
| 染色结果 | 革兰染色或特殊染色是否一致 |
| 培养特征 | 在不同培养基上的表现是否稳定 |
| 分子检测 | 必要时用16S rRNA、ITS或其他方法确认 |
| 传代稳定性 | 连续传代后性状是否一致 |
若同一菌落再次划线后出现不同形态菌落,应考虑原菌落并非纯菌,或存在污染、相变、变异和混合菌共生等情况。
小结
微生物分离纯化的本质,是将混合微生物逐步分散、筛选并获得稳定的纯培养物。平板划线法适合菌种纯化,稀释涂布法适合分离和计数,倒平板法适合较大体积样品计数,选择培养法适合复杂样品中的目标菌分离。
无论采用哪种方法,都应认识到“单菌落”并不绝对等于“单细胞来源”。规范的稀释、接种、培养、再次纯化和纯度确认,才是获得可靠菌株和准确检测结果的关键。




